Le 18 mars 2016, Guillaume DECOCQ a reçu le Prix du Conseil de la Société Botanique de France lors d’une cérémonie publique se déroulant à Paris, rue de Grenelle, dans le grand amphithéâtre de la Société française d’Horticulture. Cette distinction lui a été décernée par le Conseil d’Administration de la Société pour récompenser sa contribution à la botanique, à travers ses travaux de recherche et ses activités pédagogiques, en particulier à travers le Diplôme d’Université (DU) en « Botanique de terrain », qu’il à mis en place à l’Université de Picardie Jules Verne.